前文中介紹到，初次發作的陰部皰疹可在治療後痊癒，有些也可能自行痊癒，但是病毒仍然會潛伏在體內，遇到發熱、創傷、情緒激動、胃腸功能紊亂時病毒啟用，陰部單純皰疹再次復發。
一般來說此病復發前有前驅症狀，如陰部感染異常，複發性陰部皰疹比初次病毒感染較輕，通常可在一週內自然消失，但是一旦出現了復發便可能多次發作。
陰部單純皰疹復發前多數是由感冒、發燒、疲勞、消化不良等因素誘發的，復發時患者自覺嚴重的瘙癢感，但是復發後的陰部單純皰疹症狀與原發性陰部單純皰疹症狀相比會輕一些，也沒有淋巴結腫大，病程稍微短。但是複發性陰部單純皰疹男性可能導致尿瀦留、陰莖無法勃起等症狀，女性則會大大增加患宮頸癌的風險。
複發性陰部單純皰疹多數在感染病毒的1-4個月後復發，臨床表現與原發性相似，但是症狀較輕。複發性陰部單純皰疹症狀的皮疹範圍較小，病程也不長可在數日內自愈。復發此病的前一天區域性有刺癢和燒灼感，臨床中復發陰部單純皰疹的患者多數為男性，並且通常與感染、發熱、潮溼、寒冷等有關。